Independiente de Miraflores fue fundado el 30 de agosto de 1983.1 En 2008 el club clasificó a cuartos de final en el Interligas de Lima, instancia en la que fue derrotado por Sporting Ermitaño de Independencia.
Copa Perú 2009

En la Copa Perú 2009, el club clasificó a la Etapa Nacional, pero fue eliminado por el Tecnológico de Pucallpa.2
Copa Perú 2011

Sería subcampeón del Interligas de Lima por detrás de Pacífico FC. Ya en la Etapa Departamental de Lima, clasificaría a la semifinal eliminando a Pacífico FC, pero el equipo rosado hizo un reclamo aduciendo que el equipo albo utilizó al jugador Raúl Maguiña, que estaba inhabilitado de jugar por acumular 3 tarjetas amarillas, con lo cual el equipo rosado clasificó a semifinales de la Etapa Departamental de Lima3 y DIM se regresaría a jugar desde su Liga Distrital a partir del 2012.
Copa Perú 2012

En 2012, DIM fue campeón de la Liga Distrital de Miraflores y subcampeón del Interligas de Lima Metropolitana, donde clasificó a la Etapa Departamental.